Jaja se mogu skladištiti na sobnoj temperaturi, ali će dulje ostati svježa ako ih čuvate u hladnjaku, posebno tijekom toplijih mjeseci. Najbolje ih je ostaviti u originalnoj ambalaži, a ne u ugrađenim pretincima hladnjaka. Hladnjak nije prikladno mjesto za odlaganje svih namirnica, jer način skladištenja treba prilagoditi temperaturi i vlazi u prostoriji. Kod domaćih jaja svježinu je ponekad potrebno procijeniti samostalno, jer test s uranjanjem jaja u vodu ne može pouzdano pokazati je li jaje pokvareno. Pokvareno jaje najčešće ima neugodan miris, dok neuobičajen izgled također može biti znak da jaje nije jestivo. Jaje koje ispliva u vodi nije nužno pokvareno, nego je starije jer se njegova zračna komorica s vremenom povećava.