Musaka se može peći na 190 stupnjeva, a tijekom pečenja krumpir često ostaje tvrd i unutrašnjost suha. Jednostavan preljev od dva jaja i 250 ml jogurta omekšava krumpir i daje kremasti završni sloj. Preljev se ulije iz sredine posude prema rubovima, lagano se raspoređuje poleđinom žlice, a musaka se vraća u pećnicu na dodatnih 20–25 minuta. Nakon pečenja, krumpir se provjerava vilicom; ako lako prolazi, musaka je gotova, a krumpir se ostavlja deset minuta da se sokovi rasporede prije rezanja.