U mikrobiološkim genomima postoji veliki udio gena označenih kao „unknome“, čiji se funkcionalni značaj još uvijek ne zna. Autori ističu da ti nepoznati geni čine značajnu prepreku u mikrobiologiji jer se često izostavljaju iz genomske analize. Predlažu da mnoge od tih funkcija sudjeluju u biotičkim interakcijama i komunikaciji među mikroorganizmima ili s njihovim domaćinima, a da se ne manifestiraju u standardnim laboratorijskim uvjetima. Za otključavanje unknoma preporučuje se korištenje ekološki relevantnih eksperimentalnih sustava, poput ko-kultura i in situ analiza, kako bi se razotkrila skrivena genetska repertoarija. Autori napominju da slični „tamni“ udjeli nekarakteriziranih gena postoje i u eukariotskim genomima, uključujući i ljudski genom, te da sustavni pristupi mogu promijeniti način povezivanja genotipa i fenotipa u kontekstualnim, interakcijskim biološkim sustavima.