Patrick Stewart je treći put stupio u brak, a ceremoniju je vodio njegov bliski prijatelj i kolega Ian McKellen, poznat po ulozi Gandalfa. Prvi je brak sklopio 1966. s plesačicom i koreografkinjom Sheilom Falconer, s kojom je imao sina Daniela i kćer Sophie, a razveli su se 1990. godine.

Drugi brak, s televizijskom producenticom Wendy Neuss, započeo je 2000., a razveli su se 2003. godine. Treću je suprugu, američku kantautoricu Sunny Ozell, upoznao 2008. u Brooklynu dok je glumio u tragediji Macbeth, a vjenčali su se kada je Stewart imao 73 godine, a Ozell 35.