Direktor Rail Baltic Estonije Anvar Salomets najavio je da bi estonski dio Rail Baltice trebao biti dovršen i u pogonu najkasnije do kraja 2034. godine, iako je vlada odustala od cilja izgradnje do 2030. godine. Prema njegovim riječima, odgoda od nekoliko godina malo će utjecati na poslovanje teretnih prijevoznika, jer će razlika između 2030. i 2032. godine imati neznatan učinak na dugoročni teretni promet.
Trošak projekta u Estoniji porastao je s prvotno planirane milijarde eura na 3,5 milijarde eura, a povećanje cijena pripisuje se promjenama opsega radova i krizama koje su cijene podigle za desetke posto. Trenutačni plan predviđa da prvi vlak za Berlin krene najkasnije do kraja 2034., dok bi dionica Tallinn–Pärnu trebala biti otvorena za putnike do kraja 2032., pod uvjetom da bude osiguran financijski okvir.
Analiza troškova i koristi pokazuje da će godišnji troškovi održavanja i rada estonskog dijela iznositi između 30 i 50 milijuna eura, ovisno o rasporedu većih održavanja.
