Istraga je pokazala da je teretni vlak najvjerojatnije prošao kroz crveno svjetlo, što je dovelo do sudara dvaju vlakova na istom kolosijeku. Jedan od vlakova uspio je zakočiti, čime je izbjegnuta veća tragedija i spriječen gubitak života. Vatrogasne postrojbe iz Križevaca, Svetog Ivana Žabna i Đurđevca sanirale su istjecanje goriva iz lokomotive. Ministar Oleg Butković najavio je da će raščišćavanje i uklanjanje vagona započeti tek nakon završetka terenskih radnji, a procjenjuje se da će trajati oko 24 sata. Za putnike na relaciji Bjelovar‑Zagreb osigurana je alternativna linija prijevoza dok se promet ne normalizira.