Jerko Leko sklopio je brak u lipnju 2012. godine s poznatom manekenkom i voditeljicom Ivom Šarić. Par je iz braka dobio dvojicu sinova, Carlosa i Leona, a brak je službeno okončan razvodom 2017. godine.
Nakon razvoda Iva Šarić rodila je u travnju 2021. godine sina Adriana s Dinamovim napadačem Brunom Petkovićem, s kojim se vjenčala u prosincu 2023. godine. Leko je od tada u stabilnoj vezi sa samozatajnom Ivanom iz Livna, koja ne traži javnu pozornost.
U veljači 2024. godine par je dobio kćer, Lekovo treće dijete i njegovu prvu kćer.
