Državni inspektorat ima značajan manjak zaposlenih, jer je gotovo 40 posto radnih mjesta nepopunjeno. Prema službenom godišnjem izvješću o radu Državnog inspektorata za 2025. godinu, predviđeno je 1.976 radnih mjesta, ali ih je na kraju prošle godine bilo popunjeno samo 1.208. Problem nije samo u broju zaposlenih, već i u njihovoj dobnoj strukturi, jer čak 57 posto državnih službenika Državnog inspektorata ima preko 51 godine. Inspektorat ima širok raspon poslova, od nadzora rada, trgovine i turizma do građenja, zaštite okoliša, veterinarstva i poljoprivrede. U pojedinim inspekcijskim područjima manjak ljudi je izražen, primjerice u području radnih odnosa i zaštite na radu. Trenutačno Inspektorat nema glavnog državnog inspektora jer je Vlada Andriju Mikulića razriješila dužnosti 27. studenoga 2025. godine, a novi čelnik do danas nije imenovan. Godišnje izvješće također bilježi interne probleme, uključujući tri postupka zbog lakih povreda službene dužnosti i tri kaznene prijave zbog sumnje u počinjenje kaznenih djela protiv zaposlenika.