U radu je predstavljen ContactSeek, okvir temeljen na umjetnoj inteligenciji koji koristi vjerojatnost kontakta predviđenu modelom AlphaFold3 za povećanje specifičnosti genomskih uređivača. Autori su ga demonstrirali na Cas9‑TadA adeninskim baznim uređivačima, pri čemu su najprije mapirali njihove off‑target lokacije i zatim ih proslijedili AlphaFold3 modelu. Analiza je otkrila susjedne rezidui Cas9‑proteina čiji su kontaktni obrasci s DNOM ili voditeljskim RNOM promijenjeni, a najvažniji rezidui su identificirani i mutirani. Kombinacija dviju mutacija na Cas9 i TadA8e rezultirala je varijantom koja je prema sekvencijskim i funkcionalnim testovima nadmašila poznate visokofidelnije adeninske bazne urednike, a metoda je također primijenjena na Cas12a‑temeljene citosinske bazne urednike.
ContactSeek poboljšava specifičnost baznih urednika pomoću AlphaFold3
Izvori
Originalni sadržaj iz javnih izvora. Pune članke ne objavljujemo — kliknite za izvornu publikaciju.
- Nature.com (2026-07-22 21:45) Pročitaj original ↗
AI će pretražiti dodatne izvore i sintetizirati detaljniji sažetak (8-12 rečenica) iz više izvora. Rezultat se ne sprema javno i ne indeksira.