Bakterije razvile su raznolike anti-virusne obrambene sustave koji moraju točno prepoznati infekciju i izbjegavati pogrešno aktiviranje. U posljednjih nekoliko godina proširila su se otkrića o bakterijskim imunološkim mehanizmima, ali još uvijek nije jasno kako sustavi prepoznaju napad bakterijskog virusa. Ovaj pregled klasificira poznate okidače u tri skupine: bakterijske nukleinske kiseline, bakterijski proteini i poremećaji u procesima domaćina. Za svaku skupinu sažeti su trenutni dokazi i istaknuti novi principi koji povezuju različite obrambene mehanizme. Fokusiranjem na detekciju, a ne na reakcije, cilj je ponuditi kohezivni okvir za razumijevanje kako bakterije razlikuju sebe od nečeg drugog.